同济大学共承担两项国家教育体制改革试点项目，分别为“创新人才培养综合改革”和“形成双学位培养规模，提高联合培养人才质量和水平”。此外，该校土木工程学院也被列入国家首批17所教育体制改革“试点学院”之一。
为切实做好国家教育体制改革试点项目的统筹协调和实施推进，学校于2010年10月成立了“同济大学教学改革与发展办公室”（简称教改办）。教改办作为同济大学教务委员会下设机构，是在校党政领导和分管校长的直接领导下，综合协调各职能部门的平台。教改办在人员组成上实行专兼职并举的特殊人事政策。由校教务处、研究生院、外事办公室的处级负责人担任教改办的副主任，均为兼职岗位。专职秘书3名，由教务处、研究生院、外事办公室的现任正科级人员担任。目前，“试点学院”秘书处，“卓越9校联盟”秘书处、“中欧工程教育联盟”秘书处也设在教改办。
两年来，同济大学充分发挥教改办“教改智库、政策修订、综合协调、信息发布”的基本功能，形成了“五个一”特色，在有效促进国家教育体制改革试点项目的统筹协调和实施推进方面取得了良好效果。
一张皮：促进3个国家教育体制改革试点项目与学校工作充分融合。该校在具体工作中注意将“985工程”、“十二五”规划等各项工作与试点改革紧密结合，将各职能部门与各学院的具体工作与试点改革紧密结合。在国家教育体制改革试点项目的推进中，推动学校整体工作向前发展。
一个核心：将3个国家教育体制改革试点聚焦于“创新型的卓越人才培养”这一核心。“创新人才培养综合改革”作为人才培养的基础建设，全面提高人才培养质量，凸显“实践型”的同济大学人才培养特色；“形成双学位培养规模，提高联合培养人才质量和水平”，以双学位为核心，强化人才培养的国际化的要素和资源支撑，形成国际化教学环境，凸显“国际化”的同济大学人才培养特色；“试点学院”则着力于突破体制机制瓶颈，在现代大学制度建设上进行探索和实践。
一盘棋：全校上下统筹布局、协同合作，形成一盘棋。3个国家教改试点项目牵涉面非常广，涉及面已经超过了同济大学的“半壁江山”。“卓越工程师教育培养计划”、“卓越医生教育培养计划”和“卓越法律人才培养计划”，这3大卓越计划中仅“卓越工程师教育培养计划”就已经覆盖了全校50%的学生。学校在土木工程国家试点学院之外，还将设计创意试点学院和测绘与地理信息试点学院设为校级试点学院。3个试点学院总体上代表了同济大学的基本状况与发展方向，土木工程学院试点学院项目代表了同济大学传统的强势学科学院通过改革进一步跃升走向国际一流的方向，设计与艺术学院试点学院项目代表了同济大学按国际一流水平兴办新兴学科专业的方向，测绘与信息学院代表了同济大学历史优势学科走小而精小而强的复兴之路的方向，同济大学通过这3个试点学院项目，抓两头带中间，通过改革破除阻碍教育质量提升的瓶颈，创新适应未来发展需要的现代大学体制机制。“基础学科拔尖学生培养试验基地”虽尚未列入国家计划中，但严格按照国家标准执行，并按照国家拨款额度进行校级资金支持。
一个文：形成了各级各类会议协调沟通机制，从教改领导小组会（党政一把手为组长），校长办公会议、校长专题会议、到跨部门的联席会和部门与学院的联席会，各种类型的会议保证信息的上传下达和纵横沟通的无障碍，并统一通过校级文件的形式，推进各项改革举措的深入实施。
一本帐：教改支撑经费和“985工程”专项经费、“十二五”规划经费打统仗，避免资源的重复投入。
目前，同济大学以教育部正在开展的国家教育体制改革试点实施情况检查为契机，对学校承担的3项国家教改试点项目进行了阶段性总结和梳理，并努力推进试点项目的深入实施和圆满完成。