由北京理工大学、大连理工大学、东南大学、哈尔滨工业大学、华南理工大学、天津大学、同济大学、西北工业大学、重庆大学等国内九所大学组建的“卓越人才培养合作高校”，即“卓越大学联盟”， 凭借共同的理工科见长的特色和团结协作意识，坚持发扬“追求卓越、资源共享”宗旨，在学校工作的各个方面搭建合作平台、创造合作机会，合作模式已经实现了从概念到具体、从局部到全面的发展转型，合作的广度和深度不断提升。
—— 越合作、越紧密，协同合作机制进入制度化建设阶段
随着各项合作事务的推进，联盟内部已逐步建立了年度校长联席会议、职能部门联席会议和轮值主席制度。从2012年起，联盟开始建设官方门户网站，设计联盟logo，加强联盟文化建设。目前联盟网站已经成为高校间交流的平台和对外宣传的窗口。
2013年，联盟九校围绕卓越人才培养，明确了“本科生培养、研究生培养、招生就业、国际合作、资源共享、师资队伍、政策研究、协同创新和文化建设”9大合作主题，按主题确立分工合作机制，每一个主题由一家高校牵头，两家高校协助，其他高校参与。
为不断完善联盟内部的协同合作机制，提升制度建设，《卓越大学联盟章程》和《卓越大学联盟发展规划》（2013-2015年）也在今年出炉。
以高教改革和大学制度建设为契机，联盟九校启动开展“国内外大学联盟运行模式分析及研究建议”课题研究，对美国大学联合会AAU,英国罗素集团、澳洲八校联盟Go8、中国C9联盟的运行模式进行了比较分析，为联盟高校间合作的可持续发展提供战略研究和政策建议。
——人才培养、资源共享，共同提升卓越人才培养质量
三年来，联盟九校不仅实现了自主招生联合选拔、研究生联合招生和校际推免、联合毕业设计和论文评审等合作，今年还开启了“国内游学工程”的实质运作。同济大学与华南理工大学、重庆大学和天津大学实现了首届学生交流，九校正积极为交换生制定联合培养方案，推进基础课合作教学改革、教学成果经验交流、联合毕业设计等各项具体工作，计划在五年内实现一定规模的游学人数，实质性推动联盟范围内的“国内游学工程”。
2014年，九校将联合开展“优秀生源地基”建设，加强与国外高水平大学，特别是欧洲工程教育平台高校的交流合作，进一步探讨联盟在港澳台地区招生中的合作模式，共同推进招生制度的国际化。
目前，九校搭建完成联盟高校毕业生就业信息网，将充分发挥各自的学科及区位优势，联合推荐毕业生，协作开展就业市场建设。
——国际合作、机会共享，国际影响力持续扩大
“卓越大学联盟”成员中有6所高校是“中欧工程教育联盟”的成员，而且同济大学更是两个联盟的秘书处所在单位，这为两个联盟的深度合作提供了有利条件。
三年以来，“卓越大学联盟”实现了国际合作资源和机会的共享共赢。联盟高校圆满完成联合“访欧教育展”，举办了“创新国际快车移动课堂”，成功举办三届“九校三地夏令营”，在台湾与12所高校共同开展“成功之道”暑期学分课程，“阳光国际交流营”吸引了近400名学生参加，与香港大学、香港中文大学合作举办“中国传统建筑暑期研习班”，等等，受益的学生人数不断增长。
2013年，“卓越大学联盟”还与“法国综合理工学院联盟”建立了合作关系，国际合作的渠道进一步拓展。
——管理研讨、经验共享，推动全方位合作不断深入
三年来，九校积极搭建平台，促进高校管理经验的交流共享。科技管理、人事管理、图书馆、设备管理、信息化建设、学生工作等方面已经建立了相应职能部门的联席会议制度，以此推进各方面实质性合作事项的开展实施。
2013年，联席会议制度拓展到文化建设、体育发展、多校区管理、产业发展等事务方面，为推动更加全方位的联盟合作打下了基础。